Avant la récente augmentation du nombre de cas signalés, la souche EV-D68 ne présentait pas d'intérêt particulier pour la santé publique. Par conséquent, la gamme actuelle de désinfectants n'a pas été testée directement sur cette souche. Cependant, les autorités de santé publique ont fait les recommandations suivantes :

Center for Disease Control (CDC) et Centre de collaboration nationale des maladies infectieuses (CCNMI) :
"L'EV-D68 étant un virus non enveloppé, la désinfection environnementale des surfaces dans les établissements de santé doit être effectuée à l'aide d'un désinfectant de qualité hospitalière dont l'étiquette EPA revendique l'utilisation de l'un des nombreux virus non enveloppés (par exemple, l'hépatite A, l'adénovirus)."

Santé publique Ontario :
La désinfection environnementale des surfaces dans les établissements de soins de santé doit être effectuée à l'aide d'un désinfectant de qualité hospitalière dont l'étiquette indique l'efficacité contre les virus non enveloppés.